华中理工大学更名为华中科技大学的主要原因是为了与同济医科大学合并。在合并过程中，同济医科大学提出了一个条件，即合并可以，但必须改名，以达到独立的过程。尽管武汉大学曾试图合并华中理工大学，但由于不同意改名而未能成功。最终，华中理工大学接受了这一要求，并更名为华中科技大学，从而完成了与同济医科大学的合并。

这次合并发生在2000年5月26日，标志着华中理工大学正式诞生，并且在中国高等教育中占据了重要地位。合并后，华中科技大学不仅保留了同济医科大学的牌子，还继续发展其综合性大学的路线。

因此，华中理工大学更名为华中科技大学，是为了在与同济医科大学的合并中满足对方提出的改名条件，同时也有助于学校的发展和国际形象的提升。